En 1697, la propriété est vendue à maître Simon Malescot, conseiller du roi auprès du Parlement de Bordeaux. La famille Malescot restera propriétaire du domaine jusqu'à la Révolution française. En 1827, Jean-Baptiste de Saint Exupéry, arrière-grand-père de l'aviateur Antoine de Saint-Exupéry, acquiert la propriété et décide d'ajouter son nom à la dénomination du château. En 1955, Paul Zuger et son fils Roger achètent le domaine où il ne reste que 7 hectares de vignes. Il va leur falloir trente ans d'efforts pour redonner son panache au blason de Malescot et a sa devise semper ad altum (signifiant « toujours plus haut » en latin). Michel Rolland devient en 1997 l'oenologue conseil du domaine.